战斗用电子体（シュミクラム）的机师、也是原佣兵的泷沢苍（たきざわそう）正深陷烦恼。
因某件事而失去战斗能力和职位的苍，为投靠养父而回到了久违的故乡“海神（わだつみ）”岛。
佣兵时代的同伴・三纳岸优里（みなぎしゆーり）不知为何也一起跟了过来。
然而刚踏上岛，就救起一名记忆丧失的少女・月咏（つくよみ），并让她住在了自己家里。
小岛因人口密度过低而平日委托稀少，然而忽然登场的神秘人物向男主提供了工作。
内容为，编入海神唯一的学园・甲华学园（こうかがくえん），
调查校内的在籍生是否与岛上发生的恐怖袭击有所关联。
接着就在苍即将潜入学园之时，学生会会长・天濑茉绪（あまがせまお）阻挡在他的面前。
此时，自称妖精的少女忽然出现，
并和丧失了战斗能力的苍的战斗用电子体开始了同化——
